More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3504 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
585 aa  1195    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3556  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.25 
 
 
905 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88325  normal  0.39495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
674 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  53.12 
 
 
1183 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  51.92 
 
 
932 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  50.47 
 
 
790 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
913 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 
1051 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 
1093 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
1654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
912 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
1093 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
1390 aa  170  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
1177 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
964 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.38 
 
 
783 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
572 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
1714 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
1560 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 
3706 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
347 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 
488 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  42.23 
 
 
1239 aa  158  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
941 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
2693 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  39.61 
 
 
744 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
764 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
945 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
1051 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
771 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
815 aa  150  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
551 aa  150  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
681 aa  150  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
547 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
839 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
723 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
1676 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
613 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
1253 aa  143  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  39.8 
 
 
1668 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
767 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
732 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
343 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
991 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  33.82 
 
 
918 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
980 aa  140  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  39.3 
 
 
1663 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  36.95 
 
 
1248 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
215 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 
439 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
834 aa  137  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  34.48 
 
 
754 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  32.52 
 
 
1182 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  33.87 
 
 
1289 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  35.35 
 
 
746 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
1246 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
909 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  36.36 
 
 
886 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
757 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
382 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
472 aa  128  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  33.8 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
782 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
788 aa  128  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
872 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.62 
 
 
1047 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
1227 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  35.12 
 
 
704 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
771 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
1205 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
657 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.04 
 
 
892 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.71 
 
 
1210 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
856 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
924 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  34.34 
 
 
945 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  32.38 
 
 
676 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
648 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
698 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
739 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
416 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  33.79 
 
 
819 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  31.67 
 
 
800 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
832 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  32.23 
 
 
657 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
749 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  33.98 
 
 
650 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.57 
 
 
682 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
774 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
1093 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
752 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
578 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
631 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
462 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
747 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
864 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0309229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>