More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0454 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
657 aa  1358    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
1051 aa  260  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
1246 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
1177 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
1390 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
932 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
572 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
815 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
215 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
764 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
526 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
1093 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
878 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
439 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
551 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
1253 aa  164  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
1654 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
1093 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
991 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.79 
 
 
1239 aa  160  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
3706 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  37.66 
 
 
744 aa  151  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.23 
 
 
783 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
674 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
1227 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
913 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
771 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
1676 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  27.91 
 
 
945 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
912 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
613 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.68 
 
 
1182 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
771 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
681 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
839 aa  140  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
1714 aa  140  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
524 aa  140  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
488 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
980 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
472 aa  139  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
1183 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.92 
 
 
754 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
1560 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
964 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  27.27 
 
 
1248 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
479 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  31.66 
 
 
892 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
382 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
747 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
757 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
945 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
727 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
788 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
790 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
856 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
941 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
752 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
2693 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
653 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.44 
 
 
918 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
1051 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.84 
 
 
1663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
834 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  28.37 
 
 
886 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
832 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
732 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.17 
 
 
1668 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
749 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
732 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
767 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  30.52 
 
 
676 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  28.17 
 
 
819 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
746 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
924 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
631 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
771 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
585 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
909 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
813 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  26.01 
 
 
1047 aa  124  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
437 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
872 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.3 
 
 
1210 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
544 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
532 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
656 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  27.59 
 
 
387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
782 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
781 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
774 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
325 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
462 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
416 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  28.4 
 
 
800 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  31.71 
 
 
492 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  28.14 
 
 
746 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
1093 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>