More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2680 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 886 aa  1822    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  37.94 
 
 		 1182 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  63.44 
 
 		 800 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  36.89 
 
 		 1248 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  52.5 
 
 		 1047 aa  347  8e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  36.55 
 
 		 1289 aa  340  8e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  43.76 
 
 		 676 aa  338  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 936 aa  333  9e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 945 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 819 aa  327  6e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 746 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  45.38 
 
 		 657 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  38.48 
 
 		 918 aa  300  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  53.06 
 
 		 754 aa  280  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1210 aa  278  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 1093 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 1093 aa  274  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 704 aa  263  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 980 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  43.03 
 
 		 449 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 1390 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 682 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 1676 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 892 aa  231  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 834 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 1714 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 1246 aa  216  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  29.35 
 
 		 1379 aa  213  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 991 aa  211  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 3706 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 572 aa  209  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 		 1028 aa  208  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.16 
 
 		 1239 aa  207  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 488 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  35.19 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 815 aa  203  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 903 aa  201  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 1654 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 839 aa  196  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 681 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  26.29 
 
 		 744 aa  193  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 964 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 932 aa  190  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 551 aa  190  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 1205 aa  185  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 462 aa  183  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 767 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 913 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 771 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 1051 aa  181  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 		 945 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 1253 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 1078 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.42 
 
 		 781 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 631 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 526 aa  174  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 524 aa  173  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 613 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  26.8 
 
 		 1065 aa  172  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 723 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.74 
 
 		 1021 aa  170  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  35.38 
 
 		 1187 aa  170  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 382 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 2693 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 547 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 1051 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 912 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 1791 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.38 
 
 		 1143 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.38 
 
 		 1143 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 1177 aa  161  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 		 1029 aa  161  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.96 
 
 		 1079 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 439 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 535 aa  158  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 1560 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 909 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 924 aa  155  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.62 
 
 		 1663 aa  155  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 347 aa  155  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.4 
 
 		 1668 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 1227 aa  154  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.2 
 
 		 878 aa  154  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 732 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  37.79 
 
 		 830 aa  152  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 878 aa  147  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 		 891 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 872 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 215 aa  144  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1076 aa  144  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 904 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 		 1065 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 788 aa  142  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 790 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 		 1432 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 813 aa  137  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 941 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2678  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 698 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>