More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4139 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
913 aa  1868    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
945 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
912 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 
1051 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  59.55 
 
 
790 aa  296  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
932 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
937 aa  244  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
1093 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
1093 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 
730 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  27.61 
 
 
967 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  27.61 
 
 
967 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 
1119 aa  227  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
1676 aa  227  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  29.39 
 
 
608 aa  221  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
674 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
788 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  50.67 
 
 
1183 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
551 aa  211  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
1026 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 
1058 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
681 aa  208  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.12 
 
 
783 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 
1078 aa  204  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.43 
 
 
1239 aa  203  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
1253 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
815 aa  202  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
839 aa  201  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 
1133 aa  201  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
1246 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
1177 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
771 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.68 
 
 
744 aa  188  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  31.86 
 
 
705 aa  187  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
3706 aa  187  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
585 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  28.76 
 
 
608 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  28.76 
 
 
608 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
964 aa  183  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  26.65 
 
 
886 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
1654 aa  181  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
572 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.27 
 
 
676 aa  178  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  28.7 
 
 
704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  30.41 
 
 
892 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
526 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  24.96 
 
 
834 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
767 aa  174  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
1051 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  34.05 
 
 
354 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
547 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  29.2 
 
 
872 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 
1207 aa  170  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
1560 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.31 
 
 
945 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.03 
 
 
754 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
1714 aa  168  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
613 aa  168  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
488 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  27.62 
 
 
1182 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  26.97 
 
 
1130 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
1390 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
439 aa  163  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.28 
 
 
1248 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
878 aa  162  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.79 
 
 
1663 aa  162  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.5 
 
 
918 aa  161  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
872 aa  160  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
479 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.34 
 
 
1668 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  29.27 
 
 
1047 aa  159  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
2693 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
935 aa  158  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
723 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
764 aa  157  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.38 
 
 
1210 aa  154  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  29.37 
 
 
746 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
991 aa  151  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
524 aa  151  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
980 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27.88 
 
 
819 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
347 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
732 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
657 aa  148  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  25.5 
 
 
657 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
941 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
909 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
1070 aa  145  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
856 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
727 aa  144  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  28.61 
 
 
492 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  27.17 
 
 
682 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
782 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  27.35 
 
 
449 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1070 aa  140  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  28.48 
 
 
936 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
816 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
774 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  39.81 
 
 
624 aa  137  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
532 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>