More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2753 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 325 aa  633  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.32 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  35.87 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  35.13 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 1239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 752 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 771 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 878 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 815 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 1654 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 1227 aa  122  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 1714 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 764 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 681 aa  122  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 472 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 613 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1210 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 757 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 771 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.97 
 
 		 1668 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 657 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 941 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.97 
 
 		 1663 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.27 
 
 		 744 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 532 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 1253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 3706 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 682 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 782 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 2693 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 856 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1177 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 964 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 832 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 732 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 572 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 603 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.45 
 
 		 783 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 747 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 746 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 1051 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 1560 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 980 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 1390 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 674 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 749 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 813 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 215 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 382 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 834 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 913 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 839 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 361 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 788 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 704 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 551 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  34.45 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 945 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 1676 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1173  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171534  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 739 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 912 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  32.09 
 
 		 676 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 936 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 732 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.31 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 492 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 991 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 465 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  31.9 
 
 		 624 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 723 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1289 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 381 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 487 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 932 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 387 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 461 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 819 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 400 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  27.71 
 
 		 754 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 945 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 1246 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>