More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1173 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1173  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171534  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3488  hypothetical protein  37.75 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.387521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 400 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 325 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 465 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.32 
 
 		 381 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 461 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 381 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 547 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 439 aa  98.2  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 345 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2348  putative signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  34.18 
 
 		 344 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.18 
 
 		 783 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 405 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 348 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 420 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 382 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 392 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 739 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 603 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 351 aa  92  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.51 
 
 		 338 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 344 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 364 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2439  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 366 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0424622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 348 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 365 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 356 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 382 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 408 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 414 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  36.41 
 
 		 400 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 349 aa  89  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3015  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  35.52 
 
 		 366 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 771 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 1676 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 431 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 909 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 782 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 749 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 398 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 368 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 354 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 416 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 732 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 437 aa  85.5  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 382 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 334 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.39 
 
 		 744 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0589  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0760576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  29.7 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 1390 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 856 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.43 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1177 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 350 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 500 aa  82  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 514 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 747 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 1047 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 839 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 616 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 541 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3963  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 538 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  31.53 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 674 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  30.59 
 
 		 500 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 874 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 362 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 757 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 551 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 360 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 358 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 878 aa  78.6  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>