More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2909 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  65.63 
 
 
521 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  75.51 
 
 
497 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  68.01 
 
 
503 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
487 aa  972    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  65.23 
 
 
514 aa  622  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  58.35 
 
 
509 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  58.51 
 
 
490 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  55.78 
 
 
491 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  52.66 
 
 
492 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  54.53 
 
 
493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  53.63 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  53.44 
 
 
520 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  51.95 
 
 
484 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  52.27 
 
 
508 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  52.85 
 
 
500 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  52.27 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  52.48 
 
 
516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  50.31 
 
 
517 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 
492 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  49.9 
 
 
492 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  53.66 
 
 
494 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  48.68 
 
 
489 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 
512 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 
490 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
500 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
496 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
496 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 
496 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  44.91 
 
 
500 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
496 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  45.16 
 
 
501 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 
496 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  39.31 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
497 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 
502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
475 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
480 aa  266  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
492 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
470 aa  180  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
465 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
478 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  23.36 
 
 
475 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
681 aa  133  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.65 
 
 
1239 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
613 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
551 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
526 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
636 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.77 
 
 
744 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
1654 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  30.92 
 
 
1248 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
3706 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
674 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
932 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  30.61 
 
 
945 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
924 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
1093 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
1051 aa  114  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
1093 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.4 
 
 
754 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
1390 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.28 
 
 
918 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
1227 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  32.23 
 
 
682 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
1183 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
408 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
991 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
878 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
400 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
462 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  30.04 
 
 
676 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.2 
 
 
886 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
764 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
815 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
757 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
941 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
964 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
572 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
1253 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
909 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
2693 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
839 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
732 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
747 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
488 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
461 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
856 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  29.48 
 
 
657 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30.58 
 
 
449 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
431 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
358 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
1676 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
834 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
945 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
358 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
325 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
739 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>