More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4695 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 364 aa  721    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  83.8 
 
 		 351 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  86.05 
 
 		 338 aa  584  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  62.65 
 
 		 348 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  57.91 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  53.4 
 
 		 345 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  63.12 
 
 		 382 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 358 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  41.69 
 
 		 356 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.74 
 
 		 744 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 1714 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 1654 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 752 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.65 
 
 		 1239 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 1227 aa  123  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 964 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 682 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 991 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 3706 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 572 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 878 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 603 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 871 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.51 
 
 		 1668 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 532 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 746 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 771 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 749 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.53 
 
 		 1663 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 381 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 757 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 1560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 839 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.97 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 813 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 875 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32.59 
 
 		 754 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 874 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 771 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 1093 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.73 
 
 		 895 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 1093 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 693 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 864 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 1676 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 913 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  30.69 
 
 		 624 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 774 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 547 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1210 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 1253 aa  106  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 1093 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 681 aa  106  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 657 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 631 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 747 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 980 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 815 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 732 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 832 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 790 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 764 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 782 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 941 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 739 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 662 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 1177 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  28.57 
 
 		 918 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1289 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 1051 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 613 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 834 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 526 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 545 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 739 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 704 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 945 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 698 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 1047 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.45 
 
 		 783 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 1390 aa  99.4  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 215 aa  99.4  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 461 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>