More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1099 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 335 aa  672    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 545 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 360 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.65 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  33.65 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 739 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 453 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 439 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 613 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 2693 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 657 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 461 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 767 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 465 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 3706 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 872 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 856 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 1093 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  29.13 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 382 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 1560 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  32.87 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 381 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  32.82 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 353 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 371 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 941 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 1051 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 1227 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 749 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 746 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.46 
 
 		 1663 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.73 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 815 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1165  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 945 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 752 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.11 
 
 		 1668 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 782 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 832 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  30.62 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 1183 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1676 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1538  signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 774 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 681 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.15 
 
 		 744 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 732 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 462 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>