More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5895 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 356 aa  724    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  50.14 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  49.28 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2439  signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0424622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3015  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  44.41 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9026  sensory transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 839 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 1253 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 872 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 878 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 439 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 3706 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 613 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 532 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 551 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 572 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 1676 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 1654 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 1246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  32.06 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 1560 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 2693 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 945 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 732 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 815 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 964 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 941 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 1177 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.8 
 
 		 754 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 368 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.67 
 
 		 783 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  27.14 
 
 		 1239 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 991 aa  106  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  28.29 
 
 		 744 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 767 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 1051 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 788 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 400 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 1093 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 932 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.72 
 
 		 1668 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 1093 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 547 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 1390 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 657 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 756 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  25.43 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 1714 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 681 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  31.22 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 545 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 1227 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  27.27 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 674 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  29.19 
 
 		 391 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 437 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 739 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 420 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 484 aa  95.9  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  22.19 
 
 		 771 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  24.29 
 
 		 918 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  26.18 
 
 		 449 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 1047 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 790 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 1051 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.78 
 
 		 1663 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1182 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 980 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 739 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 693 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 358 aa  92.4  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 864 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 704 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  26.07 
 
 		 1248 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 757 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 924 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>