More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9026 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9026  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 317 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  73.29 
 
 		 358 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  75 
 
 		 358 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  47.48 
 
 		 367 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 356 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3015  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  43.01 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2439  signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 839 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 1093 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 1093 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 964 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 551 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1253 aa  100  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 941 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 681 aa  99  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 439 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 788 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 472 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 215 aa  95.9  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 1390 aa  96.3  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 526 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 932 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 1246 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 674 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 878 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.67 
 
 		 783 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 648 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1051 aa  92.4  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 1714 aa  92.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  26.1 
 
 		 1239 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 872 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 693 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 991 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.84 
 
 		 1668 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 732 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 545 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.09 
 
 		 1663 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 1654 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 815 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.94 
 
 		 744 aa  89.7  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 532 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 739 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 912 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 1177 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 892 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 547 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 2693 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 771 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 585 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 437 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 1227 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 572 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 771 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 682 aa  86.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1210 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 600 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 613 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 1560 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 704 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 913 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 909 aa  84  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 790 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 616 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 813 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 1676 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 945 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 1183 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30.47 
 
 		 449 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 924 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  26.75 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 864 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  28.78 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 1051 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 832 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 764 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  27.81 
 
 		 1248 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 3706 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 886 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1182 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 774 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 1093 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 936 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 756 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 727 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>