More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2946 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 349 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  75.64 
 
 		 371 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  73.31 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  58.59 
 
 		 353 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 358 aa  245  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 357 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 815 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  30.09 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 1654 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 746 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 771 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  34.12 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 1239 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 551 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 356 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 3706 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.43 
 
 		 744 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  34.65 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 732 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 492 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 1560 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 752 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 613 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 360 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 572 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 488 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 526 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.65 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 872 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 1253 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1676 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 767 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.41 
 
 		 783 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 941 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 991 aa  99.8  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 832 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 349 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 1714 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 532 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 788 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 945 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 771 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 839 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 747 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 739 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.71 
 
 		 1668 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1538  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 232 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 964 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 465 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 547 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 344 aa  97.1  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 2693 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 462 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 348 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1165  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 603 aa  95.9  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 721 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.95 
 
 		 754 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 545 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 1390 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 932 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1210 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 1177 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 709 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 1093 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 878 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 834 aa  94  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 408 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  27.19 
 
 		 333 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>