More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2206 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 272 aa  564  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 739 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 752 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 832 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 		 774 aa  181  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 749 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 746 aa  175  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 747 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 757 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 437 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 698 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 782 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 856 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 813 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 732 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 1654 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 681 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 526 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 532 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 807 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 551 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 771 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.18 
 
 		 1239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 815 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 732 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 771 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  36.87 
 
 		 783 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 1253 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 572 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 764 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 1714 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 488 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 756 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 1093 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 1093 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  34.8 
 
 		 754 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 1560 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 1390 aa  125  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 613 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 991 aa  125  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 964 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 872 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.85 
 
 		 744 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 1246 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 1093 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 1047 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 834 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 1676 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 723 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1289 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 347 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 215 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 2693 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 886 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 1051 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 524 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 439 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 648 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 382 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 1177 aa  115  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.3 
 
 		 1663 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 693 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  31.63 
 
 		 657 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 788 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 878 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 631 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 657 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  32.34 
 
 		 918 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 767 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.37 
 
 		 1248 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 545 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1210 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.8 
 
 		 1668 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 682 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 547 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 603 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 945 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 941 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 674 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 980 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  29.72 
 
 		 676 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 3706 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  30.21 
 
 		 650 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  29.31 
 
 		 800 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 1183 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.23 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1182 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 819 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 932 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 839 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 704 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  27.91 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 358 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>