More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4364 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 807 aa  1675    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 813 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 832 aa  344  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 782 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 739 aa  270  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 752 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 747 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 746 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 		 774 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 856 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 749 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 		 757 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 756 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 698 aa  210  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 732 aa  200  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 437 aa  195  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 771 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 648 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 272 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 1654 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 1714 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 1093 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 488 aa  141  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 572 aa  140  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  30.73 
 
 		 624 aa  137  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 815 aa  137  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.15 
 
 		 1239 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 681 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 439 aa  135  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  36.11 
 
 		 783 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 771 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  37.25 
 
 		 1668 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 693 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  38.5 
 
 		 744 aa  130  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 382 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 1560 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.45 
 
 		 1663 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 834 aa  127  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 362 aa  127  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 362 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 347 aa  126  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 991 aa  126  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 362 aa  125  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  34.93 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 551 aa  124  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 913 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  35.44 
 
 		 754 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1390 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 1253 aa  122  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 3706 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 674 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 723 aa  121  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 964 aa  121  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 363 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1182 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 1093 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 511 aa  119  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 1093 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 878 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 932 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 788 aa  118  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 1177 aa  118  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 941 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 945 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1246 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1210 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 1676 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 764 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 790 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  30.74 
 
 		 1248 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 631 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 472 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 2693 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1289 aa  115  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 892 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 354 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 682 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 1051 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 462 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 980 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  34.47 
 
 		 918 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 704 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  34.6 
 
 		 449 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 360 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 767 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 732 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 819 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 909 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 585 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 1047 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  32.88 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 746 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 1051 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 1183 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  32.57 
 
 		 800 aa  108  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>