More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2118 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
572 aa  1170    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.22 
 
 
853 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.66 
 
 
859 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
619 aa  327  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
619 aa  323  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  57.4 
 
 
964 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  39.78 
 
 
783 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
980 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  39.19 
 
 
1239 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
1654 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
488 aa  226  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
1714 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
1676 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  36.14 
 
 
892 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
815 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  41.73 
 
 
744 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  37.8 
 
 
1210 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
723 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  36.89 
 
 
886 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
551 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
681 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
1390 aa  206  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
3706 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
439 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 
991 aa  205  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
771 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
1093 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
1093 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  37.73 
 
 
449 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 
727 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
834 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
1177 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  39.45 
 
 
1182 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
547 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
1246 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
941 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  40.79 
 
 
682 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  35.67 
 
 
1047 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  39.79 
 
 
754 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
932 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1253 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 
347 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
1560 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
788 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
526 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
732 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
945 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  35.54 
 
 
746 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  36.89 
 
 
492 aa  191  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
767 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  38.87 
 
 
918 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
462 aa  187  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
613 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
839 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  34.21 
 
 
1248 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
2693 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
524 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  36.49 
 
 
945 aa  183  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  37.75 
 
 
704 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
913 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  34.7 
 
 
936 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  42.32 
 
 
657 aa  178  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  33.79 
 
 
819 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.03 
 
 
1668 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
382 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.79 
 
 
1663 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
472 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
657 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
1051 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
215 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  36.8 
 
 
676 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
912 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
909 aa  170  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
790 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
872 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
674 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 
782 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  37.7 
 
 
1289 aa  166  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
764 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
752 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
585 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  41.95 
 
 
800 aa  164  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1051 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
739 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
746 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
1183 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
631 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
813 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
757 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
832 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
878 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
1227 aa  156  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
856 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
437 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
732 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
545 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  42 
 
 
774 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
749 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
532 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>