More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1776 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 535 aa  1100    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  38.02 
 
 		 707 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  35.44 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 		 558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 3706 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 980 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  34.28 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 		 479 aa  174  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 964 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.21 
 
 		 744 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.66 
 
 		 844 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.66 
 
 		 844 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 651 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  28.74 
 
 		 690 aa  160  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 		 605 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 886 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  27.49 
 
 		 821 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 1654 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 771 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 526 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 551 aa  156  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 815 aa  156  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  28.21 
 
 		 715 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 681 aa  155  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 488 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 1253 aa  153  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 932 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  41.57 
 
 		 565 aa  151  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 1239 aa  150  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 1439 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 945 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 781 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  45.65 
 
 		 1113 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 1676 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 1093 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.28 
 
 		 783 aa  143  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  27.81 
 
 		 1248 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 1093 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 912 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 945 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  30.18 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 819 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  31.6 
 
 		 449 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 382 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 1714 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 1325 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 936 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 704 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 732 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.59 
 
 		 1471 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  29.41 
 
 		 449 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 1051 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  28.98 
 
 		 754 aa  133  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1182 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 892 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 682 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.09 
 
 		 676 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 746 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 839 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  31.72 
 
 		 589 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 872 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 1390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 1177 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 834 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  31.87 
 
 		 657 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 771 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 784 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 827 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  28.94 
 
 		 883 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 2693 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1210 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 767 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 547 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 991 aa  126  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 1560 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 215 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 941 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  29.62 
 
 		 603 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 723 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  24.55 
 
 		 925 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 782 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 930 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 		 913 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 1047 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 759 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2435  PAS/PAC domain-containing protein  31.34 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000625428  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  33.98 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 1227 aa  120  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 878 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1040 aa  120  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 761 aa  119  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  29.84 
 
 		 918 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>