More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1666 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 945 aa  1946    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  61.85 
 
 		 1248 aa  869    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  56.86 
 
 		 936 aa  697    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  49.4 
 
 		 676 aa  425  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  38.68 
 
 		 1182 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  43.14 
 
 		 1289 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  29.54 
 
 		 1265 aa  366  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  33.42 
 
 		 1210 aa  335  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 819 aa  331  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 886 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  54.32 
 
 		 1047 aa  321  5e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  50.15 
 
 		 800 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.5 
 
 		 721 aa  315  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  41.81 
 
 		 754 aa  304  6.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  45.91 
 
 		 918 aa  301  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 1019 aa  300  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 1758 aa  297  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 1341 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 1255 aa  281  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  59.68 
 
 		 657 aa  279  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 746 aa  278  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 2072 aa  269  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 1654 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 980 aa  266  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 3706 aa  260  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.09 
 
 		 783 aa  259  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 1714 aa  258  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.98 
 
 		 1047 aa  253  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1047 aa  251  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 892 aa  250  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1093 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1093 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 862 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 1676 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 865 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 682 aa  241  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 704 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 1390 aa  239  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  44.16 
 
 		 449 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 1548 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  29.3 
 
 		 689 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 492 aa  235  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 991 aa  221  6e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 		 834 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.33 
 
 		 1239 aa  208  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 613 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 964 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 815 aa  204  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 771 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 681 aa  202  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3647  hypothetical protein  52.76 
 
 		 305 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 1253 aa  197  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  49.76 
 
 		 727 aa  194  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 		 802 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 1177 aa  190  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 2693 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 1246 aa  184  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 		 814 aa  183  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 572 aa  183  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 462 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  34.35 
 
 		 965 aa  181  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 488 aa  181  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 839 aa  180  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 1267 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 		 1977 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 912 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1053  sensor domain-like protein  37.9 
 
 		 258 aa  173  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  26.33 
 
 		 744 aa  171  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 913 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 767 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 723 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 461 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0519  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.29 
 
 		 531 aa  164  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3111  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  38.46 
 
 		 213 aa  164  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 551 aa  164  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 547 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 382 aa  163  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 909 aa  162  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 1183 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 732 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 637 aa  161  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 1050 aa  161  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 		 1068 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 932 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1809  putative PAS/PAC sensor protein  27.9 
 
 		 868 aa  159  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 1051 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 741 aa  156  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 941 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 465 aa  156  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 		 1927 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40 
 
 		 1668 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 764 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 526 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.27 
 
 		 1278 aa  154  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 215 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 		 1418 aa  152  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 1297 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 878 aa  152  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 1516 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>