More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4528 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.61 
 
 		 2051 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  31.15 
 
 		 2077 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  45.21 
 
 		 1845 aa  1170    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 		 1908 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.43 
 
 		 1774 aa  713    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  43.95 
 
 		 1712 aa  1119    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  30.5 
 
 		 2303 aa  650    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.86 
 
 		 1748 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  32.95 
 
 		 2361 aa  761    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.74 
 
 		 1780 aa  835    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.95 
 
 		 1901 aa  739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.28 
 
 		 1805 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  31.65 
 
 		 1934 aa  737    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.89 
 
 		 1804 aa  756    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.3 
 
 		 2017 aa  717    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.03 
 
 		 1794 aa  739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  31.52 
 
 		 1850 aa  781    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.28 
 
 		 1797 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.73 
 
 		 1795 aa  744    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.71 
 
 		 1808 aa  785    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  30.3 
 
 		 2272 aa  666    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 1942 aa  769    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  47.68 
 
 		 1837 aa  1247    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  44.65 
 
 		 1697 aa  1140    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  40.13 
 
 		 1836 aa  993    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  35.88 
 
 		 1685 aa  713    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  100 
 
 		 1668 aa  3388    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  31.77 
 
 		 1914 aa  795    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  41.33 
 
 		 1822 aa  1053    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  29.92 
 
 		 2279 aa  668    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 1644 aa  659    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  39.86 
 
 		 1833 aa  973    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  43.63 
 
 		 1809 aa  1205    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  88.84 
 
 		 1663 aa  2998    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  28.86 
 
 		 1811 aa  676    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  30.93 
 
 		 1805 aa  782    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  33.29 
 
 		 1922 aa  711    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 1932 aa  792    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  36.35 
 
 		 1685 aa  724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  32.48 
 
 		 1744 aa  629  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.37 
 
 		 1871 aa  599  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.73 
 
 		 1885 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.68 
 
 		 1739 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.14 
 
 		 1780 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  29.38 
 
 		 1685 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  32.28 
 
 		 2109 aa  557  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.72 
 
 		 1797 aa  529  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  27.2 
 
 		 1682 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  28.77 
 
 		 1710 aa  523  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  27.51 
 
 		 1682 aa  523  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  29.66 
 
 		 1788 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 670 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.66 
 
 		 1885 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  29.22 
 
 		 1756 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 1637 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.19 
 
 		 1832 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 1643 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 1636 aa  390  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 		 1629 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 1123 aa  335  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 		 1726 aa  332  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  25.82 
 
 		 1112 aa  275  5.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 1649 aa  274  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  23.7 
 
 		 1064 aa  259  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 		 1473 aa  256  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 		 1473 aa  256  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 		 1473 aa  253  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.23 
 
 		 1060 aa  250  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.18 
 
 		 1123 aa  223  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  24.15 
 
 		 1255 aa  200  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 964 aa  196  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  47.2 
 
 		 744 aa  194  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 1654 aa  191  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 1714 aa  185  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  27.69 
 
 		 1774 aa  181  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  21.54 
 
 		 2312 aa  180  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  45.67 
 
 		 783 aa  180  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 488 aa  179  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 991 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 771 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 839 aa  177  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 941 aa  176  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 		 1253 aa  175  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 		 572 aa  176  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 3706 aa  175  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  23.78 
 
 		 900 aa  175  7.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  47.55 
 
 		 439 aa  174  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 1560 aa  174  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 1093 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 1093 aa  172  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 815 aa  171  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 674 aa  171  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 932 aa  171  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  37.79 
 
 		 918 aa  170  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 2693 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 1183 aa  166  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 834 aa  166  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  37.33 
 
 		 754 aa  166  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 878 aa  165  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 		 526 aa  164  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>