More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3036 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 		 1047 aa  2150    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  44.56 
 
 		 1289 aa  645    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  54.29 
 
 		 1248 aa  633  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  54.56 
 
 		 936 aa  557  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  52.5 
 
 		 886 aa  347  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  54.32 
 
 		 945 aa  321  5e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1182 aa  318  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  37.44 
 
 		 800 aa  302  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  44.64 
 
 		 676 aa  281  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 819 aa  278  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  43.2 
 
 		 657 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 746 aa  274  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  49.06 
 
 		 754 aa  273  9e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  55.56 
 
 		 918 aa  258  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 1341 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1210 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 704 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 892 aa  225  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 1019 aa  225  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  41.41 
 
 		 449 aa  218  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 492 aa  210  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 		 834 aa  205  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 682 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  27.51 
 
 		 783 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 1654 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 572 aa  197  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 1253 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 3706 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 839 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  35.27 
 
 		 965 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 1093 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 1093 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 991 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 1246 aa  174  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 1124 aa  173  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  34.45 
 
 		 1239 aa  173  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 547 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 681 aa  172  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 462 aa  172  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 488 aa  172  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 964 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  28.21 
 
 		 713 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 439 aa  169  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 1676 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 815 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 980 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 727 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 771 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  26.66 
 
 		 767 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 613 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 637 aa  163  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.01 
 
 		 744 aa  162  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 913 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 551 aa  159  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 1390 aa  158  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 524 aa  159  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 526 aa  158  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 723 aa  158  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 945 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 968 aa  156  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 1714 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 1177 aa  155  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.9 
 
 		 688 aa  154  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  36.36 
 
 		 1132 aa  153  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 631 aa  153  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1132 aa  153  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 764 aa  152  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 912 aa  151  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  24.22 
 
 		 1226 aa  150  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  27.94 
 
 		 1096 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 519 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 1096 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  39.61 
 
 		 536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.96 
 
 		 1278 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 347 aa  148  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 1560 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 1516 aa  145  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 732 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.14 
 
 		 1668 aa  144  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 1093 aa  144  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 941 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 1111 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.13 
 
 		 1166 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 1166 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 932 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.14 
 
 		 1663 aa  141  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 872 aa  141  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.69 
 
 		 862 aa  141  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  22.49 
 
 		 1560 aa  140  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 693 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.36 
 
 		 773 aa  140  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 1051 aa  140  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1464  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.62 
 
 		 1139 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 461 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 878 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3536  putative sensory transduction histidine kinase  47.26 
 
 		 161 aa  138  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0560358  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 437 aa  138  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 813 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 215 aa  137  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 382 aa  137  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>