More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4553 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  99.41 
 
 		 338 aa  672    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 351 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  83.8 
 
 		 364 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  60.8 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  60 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  62.77 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  53.09 
 
 		 345 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  42.45 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 1714 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.65 
 
 		 1239 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.57 
 
 		 744 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 1654 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 682 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 749 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 964 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 532 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 1093 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 1253 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 572 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 603 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 871 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 752 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 991 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 1227 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 746 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 1093 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 3706 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 771 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 774 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.5 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1093 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 771 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 215 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 757 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 1676 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  34.08 
 
 		 754 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 815 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 878 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 681 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 272 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 1047 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 657 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 693 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 1560 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 875 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.72 
 
 		 1668 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.13 
 
 		 783 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 832 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 813 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.84 
 
 		 895 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 1051 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  31.68 
 
 		 624 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 747 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 864 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 764 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 547 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 732 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 739 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 874 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 465 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 790 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 1183 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1210 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 739 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 839 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.3 
 
 		 1663 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 437 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  32.26 
 
 		 918 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  33.17 
 
 		 1248 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 913 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 834 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 856 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 406 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 1390 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 924 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 461 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 382 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 704 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1289 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 613 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 631 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 526 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 782 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 551 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 662 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 872 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>