More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0591 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 367 aa  738    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  50.14 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 		 358 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  47.55 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2439  signal transduction histidine kinase  42.77 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3015  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  41.57 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9026  sensory transduction histidine kinase  47.48 
 
 		 317 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 839 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 526 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 878 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 551 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 732 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 991 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 872 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 1676 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 1714 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 532 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 488 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 945 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30 
 
 		 754 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  25.73 
 
 		 1239 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 1560 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 674 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.8 
 
 		 1668 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 932 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 2693 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 215 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 964 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 815 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  26.86 
 
 		 744 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  30.36 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 1253 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 1093 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 941 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  33.03 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 547 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 788 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 1390 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 771 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 1093 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 358 aa  99.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 3706 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 1227 aa  99.4  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 358 aa  99.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 570 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.34 
 
 		 1663 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 681 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 834 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 1246 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  32.78 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 752 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 1654 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 782 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.11 
 
 		 918 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 756 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 747 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 945 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 693 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 472 aa  96.3  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 657 aa  96.3  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 1051 aa  95.9  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 764 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 1177 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 746 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 767 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  28.62 
 
 		 783 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  28.31 
 
 		 449 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 909 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 864 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  27.17 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 493 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 771 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 813 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 631 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 980 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 572 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 648 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 682 aa  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 603 aa  89.4  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 832 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  37.29 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>