More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6532 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 368 aa  691    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  62.61 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  40.52 
 
 		 366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 369 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  35.93 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  31.82 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 1676 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 839 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  35.19 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 767 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 945 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 439 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 613 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 547 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 771 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 382 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.11 
 
 		 783 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.87 
 
 		 744 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 1177 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 3706 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 572 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 1654 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 815 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 932 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 1560 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 872 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 545 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  31 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 674 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 1390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  29.41 
 
 		 541 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 1093 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 603 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 913 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 941 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 732 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 532 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  32.23 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  29.14 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  29.14 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 1093 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 662 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 526 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 964 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 2693 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 752 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  28.42 
 
 		 544 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 739 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.14 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  31.2 
 
 		 544 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 551 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.35 
 
 		 1668 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 1253 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 1047 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  30.75 
 
 		 539 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 1051 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  30.08 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 1239 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  30.64 
 
 		 533 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 771 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 878 aa  99.4  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 657 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 732 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 709 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 535 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  30.92 
 
 		 533 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 215 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 345 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 790 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.65 
 
 		 1663 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 336 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.84 
 
 		 348 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  27.22 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 465 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>