More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0623 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
334 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  66.77 
 
 
366 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  65.56 
 
 
366 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  65.86 
 
 
366 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
369 aa  292  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  42.2 
 
 
411 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
357 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
375 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
368 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  37.76 
 
 
354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  33.04 
 
 
387 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  36.5 
 
 
360 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  34.01 
 
 
345 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5559  hypothetical protein  34.82 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.0109335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  31.75 
 
 
364 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
336 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
839 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  57.52 
 
 
534 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
1390 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
336 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  45.16 
 
 
544 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  51.15 
 
 
488 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
1654 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  54.87 
 
 
534 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  50.38 
 
 
488 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  50.38 
 
 
488 aa  133  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  31.02 
 
 
539 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  31.87 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  28.42 
 
 
507 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  41.03 
 
 
541 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  51.33 
 
 
544 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
545 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  46.1 
 
 
503 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
945 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
1177 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.72 
 
 
890 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40751  predicted protein  48.41 
 
 
734 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00189379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  42.31 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  42.31 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
888 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  51.79 
 
 
534 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  50 
 
 
533 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  50.89 
 
 
531 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  32.44 
 
 
533 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  32.44 
 
 
533 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
547 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 
578 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.25 
 
 
814 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4511  putative PAS/PAC sensor protein  55.34 
 
 
164 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
1676 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
559 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.34 
 
 
913 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  44.44 
 
 
463 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  51.46 
 
 
491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
654 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  52.43 
 
 
760 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  44.44 
 
 
463 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30 
 
 
3706 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  44.14 
 
 
723 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
1560 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
349 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
941 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.46 
 
 
812 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  53.4 
 
 
580 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
572 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
347 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  37.11 
 
 
391 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
603 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
551 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  41.04 
 
 
644 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_8113  predicted protein  56.18 
 
 
103 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00382654  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
767 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
1227 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 
587 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
771 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
752 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 
1820 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.51 
 
 
1239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.46 
 
 
812 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
532 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  42.28 
 
 
680 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
746 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  28 
 
 
744 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.23 
 
 
1021 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
461 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.86 
 
 
783 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 
901 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
657 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
732 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  27 
 
 
674 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
453 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>