More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4037 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  89.59 
 
 		 366 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  100 
 
 		 366 aa  743    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  99.45 
 
 		 366 aa  740    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  65.56 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  39.71 
 
 		 411 aa  261  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  37.43 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  34.56 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  35.46 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  35.14 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5559  hypothetical protein  37.89 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.0109335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 839 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1390 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  49.22 
 
 		 534 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  43.68 
 
 		 534 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  32.1 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  47.95 
 
 		 488 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  47.95 
 
 		 488 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  32.82 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 547 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  41.87 
 
 		 533 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 945 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  42.46 
 
 		 539 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  37.56 
 
 		 541 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  40.24 
 
 		 541 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 1654 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  47.89 
 
 		 488 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  40.24 
 
 		 541 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  35.53 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 545 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.64 
 
 		 814 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  29.85 
 
 		 544 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  44.79 
 
 		 507 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  41.07 
 
 		 534 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 503 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 603 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  46.51 
 
 		 531 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4511  putative PAS/PAC sensor protein  50.42 
 
 		 164 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 572 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  37.15 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.1 
 
 		 888 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.57 
 
 		 559 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.03 
 
 		 890 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 613 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.79 
 
 		 812 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 488 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 3706 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 1177 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 1676 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 654 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 941 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 1029 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 913 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 674 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.5 
 
 		 1239 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  35.43 
 
 		 783 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 815 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 771 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  29.64 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 959 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  47.37 
 
 		 723 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  40.79 
 
 		 644 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 932 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1210 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 872 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.92 
 
 		 744 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 732 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 648 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1560 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 371 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  48.65 
 
 		 580 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 215 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 532 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 462 aa  112  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 901 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  30.79 
 
 		 760 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 739 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  45.19 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 1047 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  42.76 
 
 		 570 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 767 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  45.19 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>