More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4126 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 345 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  54.01 
 
 		 348 aa  351  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  53.4 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  53.09 
 
 		 351 aa  338  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  52.78 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  47.85 
 
 		 341 aa  301  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  51.1 
 
 		 382 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 358 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 358 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  40.19 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.88 
 
 		 1668 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 913 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.58 
 
 		 1663 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 1714 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 941 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 572 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 878 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 774 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 964 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 3706 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 381 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.33 
 
 		 381 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 1253 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1560 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 788 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 815 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 613 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 603 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 551 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 1654 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  30.47 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 832 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 839 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.46 
 
 		 744 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 657 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 1051 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 757 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 752 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 681 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 1676 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1093 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 465 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1093 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 406 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 354 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 945 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 1239 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 732 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 674 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 545 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1210 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 462 aa  99.8  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  32.87 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 2693 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 932 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  31.74 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  31.25 
 
 		 800 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 834 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 570 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 991 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 756 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 1390 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 1051 aa  96.7  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 790 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.39 
 
 		 783 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 526 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1173  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 240 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171534  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 368 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 813 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 980 aa  95.9  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 732 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1289 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 1227 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1182 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 912 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>