More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3297 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  721    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  56.06 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5559  hypothetical protein  56.53 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.0109335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  42.24 
 
 		 364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  35.62 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  34.44 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  41.48 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 354 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  36.25 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 375 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  34.9 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.73 
 
 		 559 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  42.64 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  43.32 
 
 		 534 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  43.68 
 
 		 539 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  48 
 
 		 533 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  52.67 
 
 		 534 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  48.08 
 
 		 544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  47.43 
 
 		 533 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  31.51 
 
 		 541 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  31.51 
 
 		 541 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  41.41 
 
 		 541 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  49.67 
 
 		 533 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  43.43 
 
 		 531 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  47.97 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  31.82 
 
 		 1160 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 814 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 631 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.19 
 
 		 812 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  38.69 
 
 		 544 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 728 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 460 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4511  putative PAS/PAC sensor protein  58.04 
 
 		 164 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  53.38 
 
 		 503 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  30.43 
 
 		 728 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  50.39 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  50.39 
 
 		 463 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 		 491 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.04 
 
 		 890 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 409 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 		 733 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.15 
 
 		 888 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  48.53 
 
 		 488 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  48.53 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 488 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.72 
 
 		 1820 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.13 
 
 		 812 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  28.43 
 
 		 1170 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 901 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  33.86 
 
 		 822 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  28.09 
 
 		 1170 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1716  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.93 
 
 		 1238 aa  122  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  30.87 
 
 		 1027 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 654 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40751  predicted protein  48.28 
 
 		 734 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00189379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.32 
 
 		 1061 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 		 578 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  28.09 
 
 		 1165 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.74 
 
 		 1063 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  36.1 
 
 		 842 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 484 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 		 913 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  38.83 
 
 		 644 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 725 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.65 
 
 		 481 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 446 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 454 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.63 
 
 		 1021 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  36.68 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 639 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.65 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 498 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 713 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  45.93 
 
 		 743 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.25 
 
 		 1167 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0188  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.74 
 
 		 578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>