More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1259 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
578 aa  1171    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
1260 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 
1260 aa  180  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 
991 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  28.18 
 
 
1317 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 
913 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
859 aa  156  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
1820 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.59 
 
 
1021 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
1877 aa  153  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.9 
 
 
1215 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 
853 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
1146 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1893  LOV-regulator, Blue-light sensing  25.89 
 
 
920 aa  143  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423791  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0423  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.91 
 
 
498 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  51.88 
 
 
723 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 
1177 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2164  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
941 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0320639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  48.15 
 
 
580 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
737 aa  136  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  50 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 
1432 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0512  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 
945 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
642 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_8113  predicted protein  56.86 
 
 
103 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00382654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  45.33 
 
 
644 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  48.46 
 
 
544 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
769 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.05 
 
 
1254 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  27.54 
 
 
1560 aa  130  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
1287 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.92 
 
 
559 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.59 
 
 
929 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  47.69 
 
 
463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.34 
 
 
814 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.7 
 
 
878 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.75 
 
 
481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  47.69 
 
 
463 aa  128  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.45 
 
 
812 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
773 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
705 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.33 
 
 
743 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1292  putative PAS/PAC sensor protein  44.44 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  36.55 
 
 
570 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  45.8 
 
 
680 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  47.66 
 
 
541 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  47.66 
 
 
541 aa  127  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 
899 aa  127  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
620 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 
1064 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  45.38 
 
 
539 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.12 
 
 
481 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  51.75 
 
 
488 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 
1053 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  51.75 
 
 
488 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  38.42 
 
 
1178 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 
1029 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.81 
 
 
1313 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  53.1 
 
 
760 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
773 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  51.75 
 
 
488 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.84 
 
 
1183 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543508  normal  0.654737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  44.62 
 
 
533 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.84 
 
 
1183 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  48.31 
 
 
345 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1716  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.76 
 
 
1238 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 
1215 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  27.48 
 
 
1109 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.09 
 
 
905 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 
334 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
990 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.61 
 
 
941 aa  124  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
1029 aa  124  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.79 
 
 
556 aa  124  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40751  predicted protein  51.35 
 
 
734 aa  124  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00189379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.88 
 
 
778 aa  123  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
850 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  25.17 
 
 
824 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
595 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  46.09 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  48.67 
 
 
581 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
776 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.8 
 
 
888 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  28.8 
 
 
787 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
901 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
850 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  45.9 
 
 
507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  44.53 
 
 
534 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3170  putative PAS/PAC sensor protein  41.43 
 
 
148 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0594815  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
653 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  48 
 
 
890 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2561  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.03 
 
 
836 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51933  hypothetical protein  50 
 
 
142 aa  121  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  44.53 
 
 
541 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 
654 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.88 
 
 
1207 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>