More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0512 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0512  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
945 aa  1880    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683796  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2164  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  96.08 
 
 
941 aa  1716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0320639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2423  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.94 
 
 
670 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808174  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1893  LOV-regulator, Blue-light sensing  32.71 
 
 
920 aa  318  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.423791  normal  0.136547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2745  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2725  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 
834 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0569323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
1260 aa  209  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  29.38 
 
 
1268 aa  202  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
1260 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
983 aa  197  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
962 aa  193  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
1140 aa  193  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
749 aa  192  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.116264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
841 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.15 
 
 
720 aa  191  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
642 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.15 
 
 
720 aa  191  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
1151 aa  190  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.53 
 
 
989 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
845 aa  189  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
651 aa  188  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.34 
 
 
1509 aa  188  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 
953 aa  188  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
650 aa  187  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
991 aa  187  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.48 
 
 
1309 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.38 
 
 
935 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
531 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
1019 aa  185  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
845 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1700  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.82 
 
 
767 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 
1134 aa  184  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
769 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
774 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
737 aa  181  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 
1275 aa  181  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 
981 aa  181  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
1222 aa  181  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 
1079 aa  181  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.38 
 
 
1418 aa  180  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 
773 aa  180  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
1191 aa  180  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.87 
 
 
1561 aa  180  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 
927 aa  180  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
885 aa  180  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 
814 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
814 aa  179  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
943 aa  178  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 
773 aa  177  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 
540 aa  177  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  28.49 
 
 
1109 aa  177  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
714 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
925 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 
1148 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
886 aa  174  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
886 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 
810 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.81 
 
 
1428 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.26 
 
 
1051 aa  173  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
660 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
551 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
742 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 
814 aa  172  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
1106 aa  172  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
819 aa  172  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 
871 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
643 aa  171  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
837 aa  171  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 
796 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
571 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 
661 aa  171  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 
642 aa  171  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
1124 aa  170  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
1432 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
777 aa  170  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 
770 aa  170  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
1338 aa  170  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
864 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 
642 aa  170  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  31.49 
 
 
824 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
849 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
853 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.93 
 
 
860 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 
576 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 
829 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 
743 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
721 aa  168  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  29.64 
 
 
678 aa  168  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
571 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 
770 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
1275 aa  167  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  28.4 
 
 
882 aa  167  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  34.83 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 
859 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
1018 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
657 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
1132 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 
796 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 
1262 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>