More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2725 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2725  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
834 aa  1659    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0569323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
983 aa  274  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
677 aa  273  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
1260 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
673 aa  271  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
1415 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
847 aa  268  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
661 aa  267  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
1260 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1148 aa  265  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
823 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
845 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 
845 aa  262  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
857 aa  258  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
809 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
637 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.08 
 
 
946 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
1132 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
943 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
650 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
642 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
840 aa  254  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 
828 aa  253  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 
1275 aa  252  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
839 aa  252  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  36.23 
 
 
945 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  31.12 
 
 
1427 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
1011 aa  251  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
822 aa  251  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
1076 aa  250  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  37.36 
 
 
676 aa  250  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
899 aa  250  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
853 aa  250  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
769 aa  250  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  35.53 
 
 
622 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
622 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
1113 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  36.04 
 
 
945 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
622 aa  249  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  37.8 
 
 
824 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
642 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
711 aa  248  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  34.36 
 
 
1015 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1426 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
740 aa  247  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
751 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
703 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  40.2 
 
 
556 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
814 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
663 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  33.2 
 
 
845 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 
1059 aa  245  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
766 aa  245  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
770 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 
817 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
1057 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
874 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 
1106 aa  244  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 
664 aa  244  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
859 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  34.64 
 
 
872 aa  243  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  40.5 
 
 
571 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  37.93 
 
 
749 aa  243  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1018 aa  243  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
880 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
741 aa  243  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
953 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1076 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  37.08 
 
 
676 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
888 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1051 aa  242  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  34.48 
 
 
812 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
1092 aa  242  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  38.08 
 
 
527 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
925 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1115 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
814 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.13 
 
 
1108 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
1151 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
857 aa  240  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
628 aa  240  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
766 aa  240  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1350  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
699 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
821 aa  240  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  38.43 
 
 
726 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
1419 aa  240  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
867 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
949 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 
1215 aa  239  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 
766 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
557 aa  239  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
925 aa  239  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
584 aa  238  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 
1176 aa  238  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
777 aa  238  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  36.53 
 
 
654 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
639 aa  238  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
922 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
853 aa  238  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  31.24 
 
 
1086 aa  238  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>