More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0554 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  99.78 
 
 
463 aa  962    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  70.48 
 
 
491 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  100 
 
 
463 aa  966    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 
503 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 
488 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  43.11 
 
 
488 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
488 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
890 aa  203  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
586 aa  200  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
850 aa  200  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  35.28 
 
 
872 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
888 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
713 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
500 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
840 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
512 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
907 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
759 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
713 aa  170  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  39.06 
 
 
717 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  35.71 
 
 
703 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
733 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
409 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  31.75 
 
 
1041 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
1016 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
1001 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
897 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
1002 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
352 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
339 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
725 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  35.29 
 
 
728 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
304 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
455 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
481 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
341 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
728 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
738 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
484 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
372 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
465 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
387 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
489 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
639 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  41.92 
 
 
538 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  51.01 
 
 
345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
901 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
571 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
489 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
814 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  36.82 
 
 
930 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
583 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34.42 
 
 
583 aa  147  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
934 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
583 aa  146  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
601 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
582 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
413 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
930 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
677 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  38.69 
 
 
334 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
338 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
662 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
812 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5559  hypothetical protein  53.02 
 
 
342 aa  143  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.0109335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  56.36 
 
 
534 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  34.06 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  36.56 
 
 
632 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.45 
 
 
559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
336 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  56.36 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  54.55 
 
 
507 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  34.78 
 
 
261 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
380 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  26.69 
 
 
1167 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
512 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  52.73 
 
 
539 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  28.94 
 
 
499 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  46.38 
 
 
411 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  30.36 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
588 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
258 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  52.73 
 
 
544 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
929 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
498 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
489 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  53.27 
 
 
533 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
867 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  52.73 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.81 
 
 
1190 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  52.73 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  33.5 
 
 
478 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
575 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
362 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
346 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>