More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1677 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  81.67 
 
 		 850 aa  1335    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 840 aa  1628    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  60.62 
 
 		 713 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  59.51 
 
 		 738 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  59.19 
 
 		 717 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  59.65 
 
 		 713 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 		 759 aa  297  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 586 aa  297  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 503 aa  262  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 488 aa  255  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  43.6 
 
 		 872 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  37.84 
 
 		 488 aa  242  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 907 aa  243  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 582 aa  241  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 1016 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 		 1001 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  42.51 
 
 		 1041 aa  233  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  38.34 
 
 		 583 aa  231  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 583 aa  229  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 583 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 1002 aa  221  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 		 733 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 897 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 728 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  34.39 
 
 		 1202 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  39.27 
 
 		 728 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 601 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 662 aa  206  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 571 aa  206  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  48.77 
 
 		 409 aa  205  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 352 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 725 aa  204  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  43.34 
 
 		 512 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 		 577 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 349 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 491 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 465 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 		 387 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 489 aa  194  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  49.06 
 
 		 571 aa  193  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 339 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 499 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  31.78 
 
 		 463 aa  192  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  31.78 
 
 		 463 aa  192  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 481 aa  191  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  50.48 
 
 		 372 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  38.21 
 
 		 703 aa  187  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 929 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 639 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 341 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 1168 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 500 aa  178  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  49.17 
 
 		 642 aa  177  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 1714 aa  174  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 446 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 258 aa  171  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 1191 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 338 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  31.23 
 
 		 624 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  34.85 
 
 		 1160 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 413 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 304 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 588 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 602 aa  166  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 512 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  45.02 
 
 		 505 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 275 aa  165  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 745 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 934 aa  164  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  36.34 
 
 		 692 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.72 
 
 		 820 aa  160  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 263 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 507 aa  160  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  40.3 
 
 		 460 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 		 384 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 635 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 488 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 1059 aa  158  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.77 
 
 		 1167 aa  158  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  44.66 
 
 		 261 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  44.5 
 
 		 364 aa  157  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 455 aa  157  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  44.71 
 
 		 334 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 		 489 aa  156  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 677 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  42.52 
 
 		 930 aa  154  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 930 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 1039 aa  154  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 346 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 380 aa  152  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  34.5 
 
 		 500 aa  151  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 430 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 500 aa  151  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 1011 aa  151  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 635 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 717 aa  150  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 		 1027 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1086 aa  149  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 346 aa  149  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>