More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0615 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 258 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  74.79 
 
 		 275 aa  361  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  66.38 
 
 		 261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  57.42 
 
 		 411 aa  291  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  59.92 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  44.39 
 
 		 872 aa  181  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 840 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 582 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 850 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 409 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 713 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 897 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 929 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 339 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 586 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 512 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 481 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 		 488 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  42.18 
 
 		 1041 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 1016 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 930 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 384 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 642 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 		 1191 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 713 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  43.75 
 
 		 717 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 503 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 725 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 338 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  40.29 
 
 		 930 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 759 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 738 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 934 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 577 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 571 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  39.22 
 
 		 1027 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 488 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  41.38 
 
 		 505 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 559 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 602 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 1002 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 571 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 465 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 491 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 346 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 1001 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  37.86 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 413 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 901 aa  141  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 346 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 		 588 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  34.36 
 
 		 1160 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 488 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.06 
 
 		 488 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.5 
 
 		 1167 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 380 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  33.33 
 
 		 463 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  33.33 
 
 		 463 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 601 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 662 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 583 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  36.71 
 
 		 583 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 907 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 583 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  35.41 
 
 		 561 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 489 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 356 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 733 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  36.18 
 
 		 364 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 489 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.12 
 
 		 842 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.24 
 
 		 1190 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 500 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 677 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  37.95 
 
 		 728 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 336 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 454 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 728 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 507 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  33.33 
 
 		 478 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 631 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.67 
 
 		 849 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 352 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  33.84 
 
 		 856 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 365 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  40.32 
 
 		 538 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.33 
 
 		 846 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  32.76 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>