More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5922 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 346 aa  694    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  88.92 
 
 		 344 aa  591  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  71.1 
 
 		 346 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  55.96 
 
 		 662 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  55.71 
 
 		 583 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  55.5 
 
 		 601 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  54.59 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  54.84 
 
 		 583 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  54.84 
 
 		 583 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  52.71 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  51.94 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  51.47 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  51.47 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 		 484 aa  198  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 575 aa  190  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  48.79 
 
 		 588 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 		 571 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 		 372 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  42.08 
 
 		 478 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 409 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 489 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  41.18 
 
 		 872 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 489 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 725 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 1191 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 582 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  39.63 
 
 		 1160 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 465 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 897 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 555 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 339 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 759 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 488 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5729  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 907 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  39.9 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 488 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 500 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 577 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  40.44 
 
 		 483 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 586 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 850 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  38.57 
 
 		 930 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 1001 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 840 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  30.65 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 930 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  34.12 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  38.39 
 
 		 842 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  39.71 
 
 		 480 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  38.5 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 934 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.3 
 
 		 849 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 503 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  36.98 
 
 		 1170 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 489 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  36.98 
 
 		 1170 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  38.22 
 
 		 561 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 929 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 713 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 1016 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 491 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  42.16 
 
 		 1041 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 631 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 387 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  37.44 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  38.81 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  40.31 
 
 		 505 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  35.89 
 
 		 1045 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  33 
 
 		 1092 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  38.46 
 
 		 728 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 728 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 553 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 507 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  40.31 
 
 		 856 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  36.96 
 
 		 1165 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.69 
 
 		 1190 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 559 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 867 aa  135  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 481 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1551  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 642 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518292 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  33.33 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.09 
 
 		 846 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 602 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  33.33 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  37.5 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>