More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2030 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2030  putative sensor histidine kinase  100 
 
 		 313 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0741  signal transduction histidine kinase  98.72 
 
 		 356 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1635  signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4311  signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.801495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0950  Signal transduction histidine kinase protein  35.74 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 488 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 1191 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 372 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  38.35 
 
 		 488 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 488 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 503 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 929 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 713 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 586 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 491 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 725 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  36.36 
 
 		 583 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 583 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 582 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 571 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  34.47 
 
 		 463 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  34.47 
 
 		 463 aa  133  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 662 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 601 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  36.4 
 
 		 717 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 713 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.79 
 
 		 688 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  36.32 
 
 		 872 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 489 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.69 
 
 		 727 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 575 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  41.18 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 850 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.85 
 
 		 727 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 1190 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 484 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 840 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 583 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 588 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 759 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 498 aa  126  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 897 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  36.65 
 
 		 1170 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  36.2 
 
 		 728 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 349 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 728 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  36.65 
 
 		 1170 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2070  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315094  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.49 
 
 		 1027 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  32.6 
 
 		 478 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 930 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 		 732 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 488 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6248  two component LuxR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 633 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.713882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 		 727 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 550 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  34.91 
 
 		 930 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 677 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 550 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 934 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2160  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.31354  normal  0.0264622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 512 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  35.55 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 		 1165 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 		 733 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 907 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 1016 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  32.29 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 1001 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  37.18 
 
 		 1041 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  35.24 
 
 		 1160 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 867 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 1002 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 514 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 602 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 577 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  48.44 
 
 		 692 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 738 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 553 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 430 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  36.79 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 512 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>