More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0218 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 867 aa  1744    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 446 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 460 aa  214  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 455 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 498 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 759 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 725 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  40.72 
 
 		 1092 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 929 aa  164  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 550 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 512 aa  151  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  27.61 
 
 		 1160 aa  147  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  34.69 
 
 		 713 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1191 aa  146  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 550 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 346 aa  144  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  25.23 
 
 		 1248 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  30.88 
 
 		 480 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 571 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 850 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  26.77 
 
 		 1190 aa  142  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 583 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 583 aa  141  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  38.32 
 
 		 583 aa  141  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  37.04 
 
 		 488 aa  140  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 489 aa  140  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 488 aa  140  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 488 aa  140  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  26.02 
 
 		 463 aa  140  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  26.02 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 344 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 409 aa  138  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 489 aa  137  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 491 aa  137  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 572 aa  137  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.33 
 
 		 1061 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 602 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 346 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 713 aa  135  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  30.03 
 
 		 1027 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 840 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 601 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.5 
 
 		 1063 aa  135  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  28.72 
 
 		 478 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 465 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 907 aa  134  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  36.62 
 
 		 930 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1088 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 930 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  36.11 
 
 		 872 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 384 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 372 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 662 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 635 aa  132  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  35.12 
 
 		 842 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 571 aa  131  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 488 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  34.74 
 
 		 856 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1244  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 336 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 555 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  37.14 
 
 		 333 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 934 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  28.04 
 
 		 1170 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  39.09 
 
 		 717 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 713 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.44 
 
 		 849 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 575 aa  129  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 341 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 		 528 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  27.83 
 
 		 1170 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 482 aa  128  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 579 aa  128  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  37.75 
 
 		 332 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 503 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 		 1045 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 339 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 352 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 413 aa  126  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 338 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 484 aa  125  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  27.67 
 
 		 1165 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 500 aa  125  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.86 
 
 		 1167 aa  125  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 		 855 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 588 aa  124  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 901 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 380 aa  123  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 349 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 336 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1602  putative sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 311 aa  123  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  28.72 
 
 		 483 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 336 aa  122  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 1202 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 336 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 304 aa  122  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0249  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 342 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>