More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4215 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 582 aa  1153    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 929 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  44.2 
 
 		 872 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 		 1002 aa  350  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 1001 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 897 aa  335  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  44.99 
 
 		 1016 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  44.79 
 
 		 1041 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  37.58 
 
 		 728 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 728 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 603 aa  274  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 586 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 759 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 850 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  42.24 
 
 		 733 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 840 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  35.65 
 
 		 624 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  44.27 
 
 		 717 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 713 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 725 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 738 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 1191 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 		 1215 aa  224  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 		 1225 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  44.11 
 
 		 1225 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 633 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 635 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 489 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34.48 
 
 		 583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 662 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 583 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 583 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 		 372 aa  210  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 717 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 655 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 601 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.17 
 
 		 1224 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 655 aa  207  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  31.75 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 488 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  30.46 
 
 		 655 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  44.12 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 620 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 907 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 512 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  34.92 
 
 		 956 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1059 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 		 998 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 512 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  35.91 
 
 		 500 aa  193  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.21 
 
 		 1163 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 349 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 258 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  47.89 
 
 		 934 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 		 387 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 339 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1013 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 495 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 		 275 aa  183  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 930 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 338 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 1202 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3264  HWE histidine kinase  44.71 
 
 		 261 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 352 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 488 aa  180  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  44.44 
 
 		 930 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 341 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 1124 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1011 aa  179  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 344 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1103 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  32.89 
 
 		 1092 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2176  putative signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  33.67 
 
 		 1037 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  47.72 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.85 
 
 		 1303 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 489 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 380 aa  170  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  33.71 
 
 		 1132 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  48.54 
 
 		 677 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  33.25 
 
 		 692 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 999 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 1132 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 498 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  39.32 
 
 		 1027 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  31.06 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  31.06 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>