More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5794 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
717 aa  1430    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  43.13 
 
 
1202 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  45.35 
 
 
1168 aa  280  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.75 
 
 
1163 aa  245  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
496 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1059 aa  243  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  35.96 
 
 
624 aa  237  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
655 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
633 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  34.81 
 
 
655 aa  232  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  41.43 
 
 
739 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 
1124 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  35.68 
 
 
620 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
620 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
500 aa  226  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
655 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  40.66 
 
 
500 aa  221  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
1132 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  42.69 
 
 
1132 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  28.55 
 
 
1020 aa  213  7.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
635 aa  213  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
896 aa  212  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 
1011 aa  211  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
495 aa  208  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  40.13 
 
 
728 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
728 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.13 
 
 
1182 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
922 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  33.84 
 
 
847 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  38.23 
 
 
733 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1057 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
759 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  32.39 
 
 
704 aa  191  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
1076 aa  190  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
1039 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
582 aa  188  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  30.3 
 
 
1065 aa  188  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 
683 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1330 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 
1331 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 
828 aa  184  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  28.49 
 
 
872 aa  183  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
1267 aa  177  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.5 
 
 
764 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  49.17 
 
 
1081 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 
957 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3792  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 
406 aa  173  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
1065 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.66 
 
 
1324 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.12 
 
 
1131 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.74 
 
 
960 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 
929 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
789 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
916 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 
979 aa  164  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
603 aa  164  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
792 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
946 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
455 aa  161  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
1261 aa  160  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
1111 aa  160  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  34.02 
 
 
1096 aa  160  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
713 aa  159  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.15 
 
 
664 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
897 aa  158  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
1096 aa  159  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9041  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.88 
 
 
701 aa  157  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
943 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
850 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
899 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  56.59 
 
 
489 aa  151  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
909 aa  151  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  28.93 
 
 
488 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
488 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 
944 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
488 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
840 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.16 
 
 
930 aa  147  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
503 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
1001 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  31.98 
 
 
717 aa  145  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.35 
 
 
1036 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 
1092 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
713 aa  144  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.39 
 
 
1190 aa  144  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  34.1 
 
 
827 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
446 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
583 aa  143  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.4 
 
 
703 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  30.99 
 
 
583 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
907 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  29.06 
 
 
1041 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1002 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 
1086 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  30.5 
 
 
692 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
830 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  26.45 
 
 
1086 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
583 aa  140  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  35.53 
 
 
956 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>