More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9041 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9041  two component sensor kinase/response regulator hybrid  100 
 
 
701 aa  1419    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.88 
 
 
943 aa  340  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.17 
 
 
966 aa  331  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.96 
 
 
949 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  45.45 
 
 
949 aa  328  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  41.87 
 
 
1036 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
858 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1013 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
830 aa  270  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
998 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.74 
 
 
1059 aa  257  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  32.41 
 
 
956 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
1011 aa  251  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2026  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
964 aa  249  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  32.57 
 
 
827 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.82 
 
 
1651 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.67 
 
 
1646 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.48 
 
 
810 aa  241  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.51 
 
 
1631 aa  239  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.98 
 
 
1036 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
941 aa  238  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
783 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
728 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  36.11 
 
 
728 aa  234  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
1057 aa  233  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
864 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  65.34 
 
 
905 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  34.72 
 
 
847 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.37 
 
 
944 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
1076 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
686 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
1092 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1134 aa  213  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  30.14 
 
 
1086 aa  213  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 
1297 aa  210  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.88 
 
 
887 aa  208  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 
1086 aa  207  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
1089 aa  204  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
733 aa  203  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 
782 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 
927 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 
703 aa  201  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
806 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  30.69 
 
 
1065 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
781 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3111  sensory box histidine kinase  36.21 
 
 
423 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.019274  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 
789 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
785 aa  193  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
1065 aa  192  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
977 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  29.91 
 
 
783 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2978  PAS  37.75 
 
 
424 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
783 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
789 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
789 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
807 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
815 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  25.22 
 
 
931 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
812 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
1106 aa  177  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
1194 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
571 aa  176  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  31.4 
 
 
646 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
571 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 
721 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  33.02 
 
 
646 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
943 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.63 
 
 
734 aa  173  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
1965 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
942 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.46 
 
 
732 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 
769 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  39.75 
 
 
676 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
689 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
957 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1022 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
1103 aa  163  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
814 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
691 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  27.34 
 
 
1092 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
1050 aa  160  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  32.93 
 
 
691 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.41 
 
 
548 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
818 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  32.11 
 
 
691 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  51.81 
 
 
573 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
812 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
717 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 
1148 aa  157  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.85 
 
 
589 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.85 
 
 
589 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
809 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  47.62 
 
 
611 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
827 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 
611 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  47.62 
 
 
611 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  47.62 
 
 
611 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.5 
 
 
588 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131409  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  47.62 
 
 
611 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  41.2 
 
 
676 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>