More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3300 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 745 aa  1493    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 773 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 689 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 1559 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 955 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 		 754 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 1501 aa  361  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 1085 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.37 
 
 		 696 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1391 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 657 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 1478 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 657 aa  300  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1235  histidine kinase  47.69 
 
 		 573 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 652 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 		 716 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1068 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1103  histidine kinase  43.31 
 
 		 531 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.458922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 		 720 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 1330 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 1002 aa  283  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 663 aa  282  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 938 aa  272  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 806 aa  270  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 969 aa  268  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 869 aa  266  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 680 aa  259  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 933 aa  257  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1331 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1965 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 659 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 1297 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 708 aa  251  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 1177 aa  251  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3575  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 735 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1808 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1124 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 646 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 918 aa  242  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  31.4 
 
 		 1125 aa  240  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 796 aa  240  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 865 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 934 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 1157 aa  238  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 		 1611 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 639 aa  237  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1120 aa  236  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1125 aa  236  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 1433 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 835 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1578 aa  235  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1362 aa  234  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 1131 aa  234  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 1044 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 930 aa  233  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 803 aa  233  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.62 
 
 		 1759 aa  232  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 526 aa  231  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 1419 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 1548 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 678 aa  229  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  26.78 
 
 		 685 aa  227  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 940 aa  227  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 1064 aa  227  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.23 
 
 		 1380 aa  227  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.79 
 
 		 1535 aa  227  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  39.59 
 
 		 1131 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  29.78 
 
 		 1626 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 1236 aa  225  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 889 aa  224  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1236 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1236 aa  224  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1059 aa  224  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 865 aa  223  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 893 aa  223  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 1234 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  29.8 
 
 		 1188 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1050 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 955 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 628 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 		 696 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 1431 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1557 aa  221  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 1084 aa  220  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 		 1238 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 1363 aa  220  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 1184 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 568 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 1238 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 678 aa  217  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  28.86 
 
 		 1135 aa  218  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.76 
 
 		 1220 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 1238 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 631 aa  217  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 882 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 1238 aa  217  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 		 873 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 989 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1426 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>