More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3015 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2439  signal transduction histidine kinase  87.16 
 
 		 366 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0424622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3015  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  100 
 
 		 366 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  75.41 
 
 		 365 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  72.01 
 
 		 368 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 356 aa  290  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 358 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9026  sensory transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157622  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 1253 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 991 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 878 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 839 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 526 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 1239 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 732 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 3706 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 1390 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 788 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 1714 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 347 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 1246 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 2693 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 497 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 744 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.39 
 
 		 783 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 913 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 1654 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 613 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 693 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 815 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  31.46 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 1093 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 1177 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 1093 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 572 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 1560 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 932 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 909 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 532 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 215 aa  95.9  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 872 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 648 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 739 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 547 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 945 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 1676 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 941 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 747 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 924 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 964 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 892 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 674 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 1051 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 520 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 756 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 437 aa  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  28.77 
 
 		 449 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1173  signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 240 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171534  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.75 
 
 		 754 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 		 790 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 1227 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.28 
 
 		 1668 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.36 
 
 		 1663 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 771 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 813 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 746 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 749 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 511 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 545 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  26.73 
 
 		 657 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  28.24 
 
 		 494 aa  87  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 493 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 732 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 439 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 381 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 272 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 492 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  33.66 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 856 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 1051 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 936 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  28.42 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>