More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3243 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.49 
 
 		 358 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  75.49 
 
 		 358 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  42.77 
 
 		 351 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 364 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.77 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 334 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  39.54 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 532 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 878 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 603 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.28 
 
 		 744 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 3706 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 839 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 991 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 1390 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 347 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 964 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 815 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 526 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 613 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 681 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  35.27 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 547 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 945 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 941 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 511 aa  105  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 698 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 764 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 520 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 767 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 1654 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 356 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 497 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 1093 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 1560 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 932 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 682 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 674 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 832 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 1093 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 1253 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 		 494 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 732 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 1183 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 1239 aa  99.4  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 790 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 657 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 782 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 1227 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 514 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  36.84 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 493 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 496 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 492 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 496 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 488 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 1676 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 771 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 503 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 1051 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  31.86 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 2693 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 872 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1210 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 662 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.41 
 
 		 783 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 496 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 496 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 709 aa  93.2  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 494 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 496 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 913 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 521 aa  92.8  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 416 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 215 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 431 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 408 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 834 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>