More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0384 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  100 
 
 		 344 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 		 349 aa  291  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  48.63 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  48.63 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  46.87 
 
 		 354 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  47.75 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  46.88 
 
 		 348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 		 355 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 360 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 603 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 1654 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.94 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  38.18 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 381 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 1093 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 3706 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 752 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 406 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 1560 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1249  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  31.78 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 613 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 1714 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 771 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 416 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 526 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  32.19 
 
 		 437 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 739 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.58 
 
 		 1668 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 488 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 746 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 572 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 551 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  36.71 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.21 
 
 		 744 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  36.14 
 
 		 783 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 771 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 709 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.79 
 
 		 1239 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 532 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.39 
 
 		 1663 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  35.21 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 453 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1177 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 941 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 2693 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 945 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 1205 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 767 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 1253 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 932 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 749 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 864 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 674 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 991 aa  105  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 739 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 815 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 597 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 732 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 1093 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 872 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 1093 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 541 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3963  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 538 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 813 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 585 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 1227 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 1676 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>