More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1659 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  100 
 
 
476 aa  959    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  99.31 
 
 
437 aa  874    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1249  signal transduction histidine kinase  76.96 
 
 
460 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  35.26 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
497 aa  249  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
362 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
354 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  31.78 
 
 
344 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
363 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.42 
 
 
348 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
349 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
361 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
355 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
360 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
344 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
739 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
752 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
362 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
358 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
572 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
350 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
354 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
350 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
749 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
732 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
613 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
3706 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
416 aa  100  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
732 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
347 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
832 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  33.48 
 
 
366 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
366 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
991 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
1654 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
551 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
746 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
526 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
376 aa  94.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
603 aa  94.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
532 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
945 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
382 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
774 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
872 aa  93.2  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
757 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
1093 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
406 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
547 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
382 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
1714 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
1253 aa  90.5  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
369 aa  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
1676 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
709 aa  89.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  27.8 
 
 
783 aa  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  31.39 
 
 
341 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  28.06 
 
 
344 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
439 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
807 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
771 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
1560 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
350 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
681 aa  87.4  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
747 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
698 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
782 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
381 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
1390 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
495 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
545 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.02 
 
 
1210 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  29.05 
 
 
682 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.09 
 
 
744 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
215 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
788 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
325 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
364 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  35 
 
 
585 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
756 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.33 
 
 
895 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
875 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
834 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
674 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
462 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
856 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  28.21 
 
 
754 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
357 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
964 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>