More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1249 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1659  sensor histidine kinase  76.96 
 
 
476 aa  714    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1249  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
460 aa  924    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1607  sensor histidine kinase  76.72 
 
 
437 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0255  sensor histidine kinase  38.84 
 
 
480 aa  266  7e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
497 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  34.13 
 
 
344 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  30 
 
 
348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
349 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
354 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
362 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
739 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
358 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
354 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
355 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.46 
 
 
348 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
416 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
348 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
363 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  35.21 
 
 
494 aa  103  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
350 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
350 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
721 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
1093 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
746 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
603 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
526 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
495 aa  99.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
361 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
362 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2333  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
376 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
344 aa  97.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  30.14 
 
 
341 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
572 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
749 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
594 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
991 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
757 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
532 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
752 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
350 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
774 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
551 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
771 aa  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
709 aa  89.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
439 aa  89.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
872 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
1654 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
545 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  27.16 
 
 
464 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
348 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
732 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
732 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
493 aa  87  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
945 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
874 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
366 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  30.45 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.88 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  30.64 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
834 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
613 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
547 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  30.99 
 
 
783 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
1560 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  27.29 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
782 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.1 
 
 
895 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
1390 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
807 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
500 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
3706 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
856 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
875 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
756 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
1093 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
941 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
1093 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
767 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
747 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
1676 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
693 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
626 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
832 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>