More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1678 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 348 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  73.41 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  62.65 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  60.49 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  60.8 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  54.76 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  54.01 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  41.32 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 782 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  35.94 
 
 		 744 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 381 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.76 
 
 		 381 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 437 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 964 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 657 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1714 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 1654 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 416 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 757 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.11 
 
 		 1239 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 774 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 603 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 572 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 681 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 815 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 1093 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 878 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 1093 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 682 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 215 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 739 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 832 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 941 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 771 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 749 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 532 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1099  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 739 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 913 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.03 
 
 		 1663 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.02 
 
 		 1668 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 813 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 839 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 698 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 874 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 387 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 732 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 991 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 3706 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 465 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 1051 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 752 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 1390 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 875 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 545 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 790 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 439 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  34.13 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.82 
 
 		 783 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 1560 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 945 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.86 
 
 		 895 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  33.02 
 
 		 800 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 631 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 856 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 872 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 524 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 1676 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 362 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.46 
 
 		 918 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 547 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 1227 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 864 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 662 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  29.24 
 
 		 1248 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 771 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1289 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 834 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1173  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 240 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171534  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 461 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>