More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3225 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 541 aa  1082    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3963  signal transduction histidine kinase  99.81 
 
 		 538 aa  1074    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3214  ABC-2 type transporter  68.7 
 
 		 540 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 603 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 752 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 771 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1289 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.15 
 
 		 1239 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1654 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.88 
 
 		 744 aa  107  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1182 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 771 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.46 
 
 		 754 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  34.27 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 864 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 872 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 871 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 704 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 1047 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1210 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  30 
 
 		 800 aa  98.2  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 756 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 819 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 1714 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  33.03 
 
 		 387 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 783 aa  97.1  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 839 aa  96.7  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 991 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 3706 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 886 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 613 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 405 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 488 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.83 
 
 		 676 aa  94.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 674 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 382 aa  94  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 739 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 526 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 936 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 774 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 875 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 945 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 1093 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 551 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 364 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 945 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 382 aa  92  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 400 aa  92  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 351 aa  92  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  30.15 
 
 		 341 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.33 
 
 		 338 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 964 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.84 
 
 		 895 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 874 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 431 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 381 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 932 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 325 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 834 aa  90.5  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 541 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 616 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 1093 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  35.53 
 
 		 391 aa  90.1  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 732 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.79 
 
 		 918 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 764 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 215 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.23 
 
 		 381 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 362 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 815 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 350 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 535 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  27.75 
 
 		 1248 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 749 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 739 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.26 
 
 		 1663 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 572 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 757 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 545 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 746 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 361 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 334 aa  88.2  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  27.91 
 
 		 657 aa  87.8  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  27.78 
 
 		 449 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 360 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 1183 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 362 aa  87  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.34 
 
 		 1668 aa  87  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 813 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 909 aa  86.7  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 547 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 1227 aa  87  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 746 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>