More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3834 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 578 aa  1149    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 594 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 597 aa  303  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 593 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 593 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 592 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 662 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 1093 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 349 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 746 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 1093 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 585 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 603 aa  115  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 752 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 570 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 3706 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 875 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 1560 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 874 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.5 
 
 		 895 aa  110  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 1714 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.07 
 
 		 348 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 613 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 348 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 362 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 941 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 1253 aa  107  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 757 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 547 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 964 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 348 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 839 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 991 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 932 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 362 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 945 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 864 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 674 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.7 
 
 		 783 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 362 aa  103  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 1390 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 360 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 790 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 767 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  30 
 
 		 624 aa  102  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 572 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 1177 aa  101  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 406 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 1183 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 749 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 871 aa  101  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 350 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 350 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 1093 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 872 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 1654 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.8 
 
 		 1663 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 363 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 347 aa  98.2  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 913 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 1051 aa  97.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 526 aa  97.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 771 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 1676 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 732 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.71 
 
 		 1668 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 909 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.63 
 
 		 744 aa  95.9  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 215 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 362 aa  95.1  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 1227 aa  95.1  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 834 aa  94.4  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  30.3 
 
 		 344 aa  94.4  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 358 aa  94.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 747 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 771 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 497 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 488 aa  94  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 832 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 815 aa  93.6  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 732 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 1239 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 912 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 350 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 704 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 774 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 551 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 807 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 511 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>