More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0270 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
630 aa  1281    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  69.23 
 
 
888 aa  301  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  62.61 
 
 
753 aa  297  4e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.45 
 
 
582 aa  277  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
639 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
654 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  35.76 
 
 
982 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
674 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
1741 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  38.14 
 
 
657 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
642 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.68 
 
 
2468 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.84 
 
 
1698 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  32.65 
 
 
919 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
681 aa  126  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 
955 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2251  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.21 
 
 
351 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2297  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  38.17 
 
 
1025 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.93563  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2294  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.47 
 
 
518 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  33.01 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  36.53 
 
 
906 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1431  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  41.45 
 
 
806 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.333003  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  36.62 
 
 
340 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.45 
 
 
1785 aa  113  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  44.26 
 
 
378 aa  111  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.57 
 
 
1648 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
406 aa  108  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  33.49 
 
 
449 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
1276 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
635 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  28.1 
 
 
892 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
968 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 
1532 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.86 
 
 
1060 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
515 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
1124 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0421  putative PAS/PAC sensor protein  33.06 
 
 
357 aa  97.8  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.192636  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5232  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
698 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  32.09 
 
 
598 aa  93.6  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  27.43 
 
 
337 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 
1132 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  25.88 
 
 
1171 aa  92  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  23.47 
 
 
1132 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
793 aa  91.3  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0440  putative PAS/PAC sensor protein  31.96 
 
 
686 aa  90.5  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
405 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
400 aa  89.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  29.72 
 
 
479 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
873 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2452  multisensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
556 aa  89.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
381 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.18 
 
 
381 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
655 aa  88.6  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  38.02 
 
 
412 aa  88.2  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
381 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.08 
 
 
1068 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
817 aa  87.8  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
1055 aa  87.4  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.65 
 
 
1355 aa  87  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  29.38 
 
 
474 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
582 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
400 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.96 
 
 
1977 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6046  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
502 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
1399 aa  84.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
382 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1229  two component LuxR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
502 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2710  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40 
 
 
585 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132036  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  27.15 
 
 
1017 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 
1390 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2678  putative PAS/PAC sensor protein  34.53 
 
 
225 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.178712  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
1354 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.01 
 
 
1568 aa  81.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.27 
 
 
1423 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
886 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 
896 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
1069 aa  81.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1945  putative PAS/PAC sensor protein  31.41 
 
 
676 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
841 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
618 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1775  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.63 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.410369  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.44 
 
 
1090 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.44 
 
 
1090 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 
1807 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
1177 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  47.19 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
748 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.55 
 
 
1126 aa  77  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
1111 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 
884 aa  76.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
801 aa  77  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.09 
 
 
896 aa  76.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  31.13 
 
 
1210 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 
2072 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>