More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1712 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  100 
 
 		 491 aa  962    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  57.72 
 
 		 503 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  58.57 
 
 		 497 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  56.06 
 
 		 509 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  53.88 
 
 		 521 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  53.41 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  54.77 
 
 		 487 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 		 492 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  53.55 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  52.85 
 
 		 500 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  51.29 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  50.59 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 492 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  52.23 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 511 aa  428  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 484 aa  428  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  50.42 
 
 		 517 aa  425  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  49.4 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  50.81 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 		 501 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  46.31 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  47.05 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  45.11 
 
 		 501 aa  362  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 496 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 		 502 aa  303  7.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  38.2 
 
 		 494 aa  301  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 480 aa  270  5.9999999999999995e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 492 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 465 aa  169  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  24.21 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 526 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 551 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.91 
 
 		 744 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 3706 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.38 
 
 		 754 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 636 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 1390 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 834 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  28.75 
 
 		 918 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 924 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 613 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 991 aa  103  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 864 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 912 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 1051 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 674 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 1183 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 392 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 681 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 945 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.22 
 
 		 381 aa  100  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 398 aa  100  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 461 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 1227 aa  100  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 764 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 334 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 790 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 381 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 878 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 932 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 358 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 874 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  28.14 
 
 		 1248 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 747 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 1239 aa  97.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 387 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1253 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 405 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1210 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1714 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.61 
 
 		 783 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 400 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 732 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  35.27 
 
 		 356 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 572 aa  95.1  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 325 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 945 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 1177 aa  94  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>