More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3696 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  74.95 
 
 		 521 aa  752    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 514 aa  1014    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  69.17 
 
 		 497 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  65.89 
 
 		 503 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  64.44 
 
 		 487 aa  591  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  55.39 
 
 		 509 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  56.57 
 
 		 490 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  53.41 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 		 508 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  52.19 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 520 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  49.22 
 
 		 511 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 		 492 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  48.81 
 
 		 492 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  48.92 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  50.29 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  46.56 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  46.07 
 
 		 500 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 		 496 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  44.82 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  43.48 
 
 		 501 aa  362  8e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 495 aa  325  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  37.57 
 
 		 494 aa  312  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 497 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 502 aa  291  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 480 aa  289  9e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 475 aa  250  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 465 aa  170  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  23.35 
 
 		 475 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.25 
 
 		 1248 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  32.05 
 
 		 754 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.76 
 
 		 918 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 3706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.19 
 
 		 744 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 613 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 1093 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 945 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 1093 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 681 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 1253 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  31.97 
 
 		 676 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 674 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 932 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 936 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 1654 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 839 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 991 aa  109  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 834 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 819 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 526 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 746 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 551 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 682 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.24 
 
 		 1239 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 1047 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1210 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 767 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 547 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 465 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  30.43 
 
 		 657 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 215 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 1676 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 764 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.62 
 
 		 783 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1182 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 1183 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 572 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 941 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 945 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 892 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 790 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 878 aa  100  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 886 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 347 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 2693 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 431 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30.86 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 400 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>